周宁县气候站于1958年8月成立，1960年11月，周宁县气候站更名为周宁县气候服务站，由县农业局管理。1961年1月至12月，由于战备需要，气候站搬至县人委内，进行一般的气温、湿度、云状、云量观测。1963年1月隶属省气象局管理。1966年1月，周宁县气候服务站更名为周宁县气象服务站。1968年9月改归周宁县农业局管理。1970年10月改由县人武部管理。1971年3月，周宁县气象服务站更名为周宁县气象站，改归县革委会农业生产办公室管理。1980体制改革，实行以气象部门为主，气象部门与地方政府双重领导的管理体制，1988年12月起改称周宁县气象局。
